Protein–RNA interactions for Protein: P0CW18

PRSS56, Serine protease 56, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS56P0CW18 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRSS56P0CW18 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRSS56P0CW18 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRSS56P0CW18 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRSS56P0CW18 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRSS56P0CW18 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRSS56P0CW18 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRSS56P0CW18 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRSS56P0CW18 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRSS56P0CW18 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRSS56P0CW18 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRSS56P0CW18 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRSS56P0CW18 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRSS56P0CW18 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRSS56P0CW18 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRSS56P0CW18 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRSS56P0CW18 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRSS56P0CW18 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRSS56P0CW18 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRSS56P0CW18 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRSS56P0CW18 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRSS56P0CW18 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRSS56P0CW18 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRSS56P0CW18 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRSS56P0CW18 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRSS56P0CW18 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRSS56P0CW18 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRSS56P0CW18 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRSS56P0CW18 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRSS56P0CW18 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRSS56P0CW18 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRSS56P0CW18 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRSS56P0CW18 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRSS56P0CW18 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRSS56P0CW18 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRSS56P0CW18 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRSS56P0CW18 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRSS56P0CW18 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRSS56P0CW18 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRSS56P0CW18 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRSS56P0CW18 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRSS56P0CW18 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRSS56P0CW18 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRSS56P0CW18 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRSS56P0CW18 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRSS56P0CW18 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRSS56P0CW18 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRSS56P0CW18 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRSS56P0CW18 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRSS56P0CW18 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRSS56P0CW18 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRSS56P0CW18 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRSS56P0CW18 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRSS56P0CW18 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRSS56P0CW18 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRSS56P0CW18 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRSS56P0CW18 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRSS56P0CW18 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRSS56P0CW18 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRSS56P0CW18 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRSS56P0CW18 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRSS56P0CW18 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRSS56P0CW18 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRSS56P0CW18 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRSS56P0CW18 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRSS56P0CW18 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRSS56P0CW18 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PRSS56P0CW18 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRSS56P0CW18 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRSS56P0CW18 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRSS56P0CW18 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRSS56P0CW18 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRSS56P0CW18 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRSS56P0CW18 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRSS56P0CW18 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRSS56P0CW18 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRSS56P0CW18 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRSS56P0CW18 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRSS56P0CW18 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRSS56P0CW18 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRSS56P0CW18 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRSS56P0CW18 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRSS56P0CW18 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRSS56P0CW18 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRSS56P0CW18 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRSS56P0CW18 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRSS56P0CW18 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRSS56P0CW18 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRSS56P0CW18 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRSS56P0CW18 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRSS56P0CW18 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRSS56P0CW18 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRSS56P0CW18 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRSS56P0CW18 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRSS56P0CW18 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRSS56P0CW18 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRSS56P0CW18 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms