Protein–RNA interactions for Protein: P0C860

MSL3P1, Putative male-specific lethal-3 protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3P1P0C860 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSL3P1P0C860 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MSL3P1P0C860 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSL3P1P0C860 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSL3P1P0C860 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSL3P1P0C860 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSL3P1P0C860 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSL3P1P0C860 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSL3P1P0C860 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSL3P1P0C860 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSL3P1P0C860 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSL3P1P0C860 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSL3P1P0C860 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSL3P1P0C860 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSL3P1P0C860 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSL3P1P0C860 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSL3P1P0C860 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSL3P1P0C860 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSL3P1P0C860 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSL3P1P0C860 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MSL3P1P0C860 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSL3P1P0C860 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSL3P1P0C860 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSL3P1P0C860 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MSL3P1P0C860 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MSL3P1P0C860 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSL3P1P0C860 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSL3P1P0C860 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSL3P1P0C860 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSL3P1P0C860 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSL3P1P0C860 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSL3P1P0C860 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSL3P1P0C860 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSL3P1P0C860 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MSL3P1P0C860 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSL3P1P0C860 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSL3P1P0C860 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MSL3P1P0C860 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSL3P1P0C860 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSL3P1P0C860 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSL3P1P0C860 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSL3P1P0C860 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSL3P1P0C860 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSL3P1P0C860 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSL3P1P0C860 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSL3P1P0C860 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSL3P1P0C860 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSL3P1P0C860 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSL3P1P0C860 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MSL3P1P0C860 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSL3P1P0C860 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSL3P1P0C860 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSL3P1P0C860 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MSL3P1P0C860 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSL3P1P0C860 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSL3P1P0C860 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSL3P1P0C860 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSL3P1P0C860 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSL3P1P0C860 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSL3P1P0C860 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSL3P1P0C860 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms