Protein–RNA interactions for Protein: P07205

PGK2, Phosphoglycerate kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGK2P07205 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PGK2P07205 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PGK2P07205 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PGK2P07205 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PGK2P07205 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PGK2P07205 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PGK2P07205 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PGK2P07205 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PGK2P07205 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PGK2P07205 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PGK2P07205 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PGK2P07205 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PGK2P07205 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PGK2P07205 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PGK2P07205 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PGK2P07205 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PGK2P07205 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PGK2P07205 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PGK2P07205 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PGK2P07205 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PGK2P07205 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PGK2P07205 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PGK2P07205 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PGK2P07205 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PGK2P07205 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PGK2P07205 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PGK2P07205 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PGK2P07205 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PGK2P07205 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PGK2P07205 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PGK2P07205 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PGK2P07205 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PGK2P07205 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PGK2P07205 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PGK2P07205 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PGK2P07205 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PGK2P07205 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PGK2P07205 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PGK2P07205 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PGK2P07205 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PGK2P07205 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PGK2P07205 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PGK2P07205 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PGK2P07205 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PGK2P07205 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PGK2P07205 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PGK2P07205 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PGK2P07205 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PGK2P07205 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PGK2P07205 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PGK2P07205 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PGK2P07205 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PGK2P07205 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PGK2P07205 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PGK2P07205 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PGK2P07205 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PGK2P07205 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PGK2P07205 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PGK2P07205 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PGK2P07205 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PGK2P07205 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PGK2P07205 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PGK2P07205 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PGK2P07205 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PGK2P07205 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PGK2P07205 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PGK2P07205 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PGK2P07205 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PGK2P07205 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PGK2P07205 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PGK2P07205 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PGK2P07205 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PGK2P07205 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PGK2P07205 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PGK2P07205 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PGK2P07205 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PGK2P07205 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PGK2P07205 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PGK2P07205 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PGK2P07205 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PGK2P07205 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PGK2P07205 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PGK2P07205 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PGK2P07205 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PGK2P07205 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PGK2P07205 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PGK2P07205 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PGK2P07205 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PGK2P07205 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PGK2P07205 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PGK2P07205 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PGK2P07205 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PGK2P07205 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PGK2P07205 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PGK2P07205 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PGK2P07205 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PGK2P07205 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PGK2P07205 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PGK2P07205 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PGK2P07205 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms