Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLBP06746 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLBP06746 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLBP06746 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLBP06746 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
POLBP06746 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLBP06746 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLBP06746 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLBP06746 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLBP06746 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLBP06746 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLBP06746 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLBP06746 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLBP06746 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLBP06746 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLBP06746 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLBP06746 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLBP06746 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLBP06746 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLBP06746 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLBP06746 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLBP06746 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLBP06746 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLBP06746 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLBP06746 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLBP06746 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLBP06746 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLBP06746 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLBP06746 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLBP06746 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLBP06746 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLBP06746 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLBP06746 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLBP06746 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLBP06746 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLBP06746 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLBP06746 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLBP06746 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLBP06746 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLBP06746 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLBP06746 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLBP06746 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLBP06746 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLBP06746 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLBP06746 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLBP06746 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLBP06746 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLBP06746 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
POLBP06746 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLBP06746 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLBP06746 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLBP06746 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
POLBP06746 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
POLBP06746 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLBP06746 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLBP06746 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLBP06746 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLBP06746 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLBP06746 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLBP06746 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLBP06746 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLBP06746 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLBP06746 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLBP06746 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLBP06746 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLBP06746 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLBP06746 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLBP06746 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLBP06746 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLBP06746 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLBP06746 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLBP06746 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLBP06746 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLBP06746 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLBP06746 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLBP06746 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLBP06746 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLBP06746 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLBP06746 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLBP06746 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLBP06746 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLBP06746 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLBP06746 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLBP06746 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLBP06746 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLBP06746 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLBP06746 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLBP06746 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLBP06746 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLBP06746 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLBP06746 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLBP06746 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLBP06746 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLBP06746 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLBP06746 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLBP06746 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLBP06746 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLBP06746 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLBP06746 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLBP06746 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms