Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLR3DP05423 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
POLR3DP05423 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
POLR3DP05423 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLR3DP05423 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLR3DP05423 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLR3DP05423 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLR3DP05423 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLR3DP05423 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLR3DP05423 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLR3DP05423 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLR3DP05423 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLR3DP05423 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLR3DP05423 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLR3DP05423 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLR3DP05423 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
POLR3DP05423 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLR3DP05423 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLR3DP05423 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLR3DP05423 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLR3DP05423 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLR3DP05423 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLR3DP05423 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR3DP05423 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR3DP05423 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR3DP05423 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR3DP05423 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR3DP05423 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR3DP05423 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR3DP05423 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR3DP05423 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR3DP05423 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR3DP05423 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR3DP05423 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR3DP05423 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR3DP05423 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR3DP05423 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR3DP05423 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR3DP05423 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR3DP05423 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR3DP05423 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR3DP05423 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR3DP05423 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLR3DP05423 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLR3DP05423 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR3DP05423 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR3DP05423 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR3DP05423 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR3DP05423 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR3DP05423 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR3DP05423 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR3DP05423 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR3DP05423 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLR3DP05423 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLR3DP05423 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
POLR3DP05423 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLR3DP05423 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLR3DP05423 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLR3DP05423 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR3DP05423 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR3DP05423 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR3DP05423 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
POLR3DP05423 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLR3DP05423 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLR3DP05423 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLR3DP05423 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLR3DP05423 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms