Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALCAP01258 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALCAP01258 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALCAP01258 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALCAP01258 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALCAP01258 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALCAP01258 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CALCAP01258 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALCAP01258 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALCAP01258 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALCAP01258 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALCAP01258 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALCAP01258 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALCAP01258 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALCAP01258 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALCAP01258 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALCAP01258 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALCAP01258 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALCAP01258 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALCAP01258 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALCAP01258 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALCAP01258 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CALCAP01258 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALCAP01258 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALCAP01258 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALCAP01258 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CALCAP01258 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALCAP01258 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALCAP01258 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALCAP01258 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALCAP01258 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALCAP01258 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CALCAP01258 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALCAP01258 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALCAP01258 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALCAP01258 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALCAP01258 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CALCAP01258 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CALCAP01258 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CALCAP01258 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CALCAP01258 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CALCAP01258 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CALCAP01258 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CALCAP01258 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CALCAP01258 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CALCAP01258 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALCAP01258 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALCAP01258 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALCAP01258 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALCAP01258 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALCAP01258 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CALCAP01258 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CALCAP01258 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALCAP01258 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALCAP01258 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALCAP01258 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALCAP01258 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CALCAP01258 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALCAP01258 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALCAP01258 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALCAP01258 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALCAP01258 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALCAP01258 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALCAP01258 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALCAP01258 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CALCAP01258 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CALCAP01258 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALCAP01258 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALCAP01258 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALCAP01258 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALCAP01258 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALCAP01258 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CALCAP01258 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALCAP01258 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALCAP01258 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALCAP01258 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALCAP01258 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALCAP01258 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALCAP01258 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALCAP01258 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CALCAP01258 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALCAP01258 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALCAP01258 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALCAP01258 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALCAP01258 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALCAP01258 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALCAP01258 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALCAP01258 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALCAP01258 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALCAP01258 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CALCAP01258 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALCAP01258 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALCAP01258 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALCAP01258 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALCAP01258 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CALCAP01258 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALCAP01258 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALCAP01258 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALCAP01258 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALCAP01258 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms