Protein–RNA interactions for Protein: P00505

GOT2, Aspartate aminotransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT2P00505 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOT2P00505 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOT2P00505 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOT2P00505 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOT2P00505 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOT2P00505 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOT2P00505 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOT2P00505 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOT2P00505 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOT2P00505 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOT2P00505 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOT2P00505 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOT2P00505 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOT2P00505 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOT2P00505 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOT2P00505 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOT2P00505 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOT2P00505 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOT2P00505 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOT2P00505 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOT2P00505 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GOT2P00505 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOT2P00505 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOT2P00505 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOT2P00505 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOT2P00505 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOT2P00505 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GOT2P00505 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOT2P00505 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOT2P00505 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOT2P00505 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOT2P00505 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOT2P00505 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOT2P00505 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOT2P00505 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOT2P00505 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOT2P00505 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOT2P00505 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOT2P00505 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GOT2P00505 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOT2P00505 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOT2P00505 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOT2P00505 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOT2P00505 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOT2P00505 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOT2P00505 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOT2P00505 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOT2P00505 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOT2P00505 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOT2P00505 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOT2P00505 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOT2P00505 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOT2P00505 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOT2P00505 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GOT2P00505 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOT2P00505 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOT2P00505 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOT2P00505 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOT2P00505 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOT2P00505 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOT2P00505 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOT2P00505 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOT2P00505 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOT2P00505 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOT2P00505 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOT2P00505 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOT2P00505 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOT2P00505 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOT2P00505 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOT2P00505 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOT2P00505 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOT2P00505 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOT2P00505 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOT2P00505 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GOT2P00505 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GOT2P00505 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOT2P00505 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOT2P00505 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOT2P00505 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOT2P00505 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GOT2P00505 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOT2P00505 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOT2P00505 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOT2P00505 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOT2P00505 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOT2P00505 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOT2P00505 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOT2P00505 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOT2P00505 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOT2P00505 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOT2P00505 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOT2P00505 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOT2P00505 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOT2P00505 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GOT2P00505 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOT2P00505 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOT2P00505 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOT2P00505 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOT2P00505 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOT2P00505 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms