Protein–RNA interactions for Protein: O96013

PAK4, Serine/threonine-protein kinase PAK 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK4O96013 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAK4O96013 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAK4O96013 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAK4O96013 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAK4O96013 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAK4O96013 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PAK4O96013 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PAK4O96013 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAK4O96013 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAK4O96013 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAK4O96013 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAK4O96013 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAK4O96013 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAK4O96013 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAK4O96013 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAK4O96013 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAK4O96013 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAK4O96013 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAK4O96013 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAK4O96013 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAK4O96013 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAK4O96013 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAK4O96013 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAK4O96013 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAK4O96013 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAK4O96013 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAK4O96013 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAK4O96013 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAK4O96013 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAK4O96013 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAK4O96013 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PAK4O96013 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAK4O96013 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAK4O96013 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAK4O96013 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAK4O96013 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAK4O96013 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAK4O96013 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAK4O96013 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAK4O96013 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAK4O96013 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAK4O96013 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAK4O96013 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PAK4O96013 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAK4O96013 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAK4O96013 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAK4O96013 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAK4O96013 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAK4O96013 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAK4O96013 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAK4O96013 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PAK4O96013 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAK4O96013 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAK4O96013 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAK4O96013 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAK4O96013 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAK4O96013 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAK4O96013 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAK4O96013 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAK4O96013 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAK4O96013 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAK4O96013 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAK4O96013 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAK4O96013 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAK4O96013 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAK4O96013 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PAK4O96013 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAK4O96013 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAK4O96013 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAK4O96013 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAK4O96013 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAK4O96013 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAK4O96013 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAK4O96013 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAK4O96013 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAK4O96013 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAK4O96013 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAK4O96013 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAK4O96013 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAK4O96013 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAK4O96013 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAK4O96013 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAK4O96013 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAK4O96013 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAK4O96013 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAK4O96013 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAK4O96013 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAK4O96013 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAK4O96013 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAK4O96013 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAK4O96013 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAK4O96013 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PAK4O96013 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAK4O96013 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAK4O96013 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAK4O96013 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAK4O96013 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PAK4O96013 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAK4O96013 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAK4O96013 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms