Protein–RNA interactions for Protein: O95803

NDST3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST3O95803 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NDST3O95803 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDST3O95803 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDST3O95803 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDST3O95803 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDST3O95803 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDST3O95803 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDST3O95803 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NDST3O95803 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NDST3O95803 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDST3O95803 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDST3O95803 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDST3O95803 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDST3O95803 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDST3O95803 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDST3O95803 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDST3O95803 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDST3O95803 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDST3O95803 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDST3O95803 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDST3O95803 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDST3O95803 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDST3O95803 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDST3O95803 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDST3O95803 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDST3O95803 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDST3O95803 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDST3O95803 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDST3O95803 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDST3O95803 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDST3O95803 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDST3O95803 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDST3O95803 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDST3O95803 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDST3O95803 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NDST3O95803 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDST3O95803 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDST3O95803 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDST3O95803 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDST3O95803 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDST3O95803 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDST3O95803 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDST3O95803 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NDST3O95803 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NDST3O95803 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDST3O95803 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDST3O95803 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDST3O95803 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDST3O95803 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDST3O95803 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDST3O95803 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDST3O95803 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDST3O95803 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDST3O95803 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDST3O95803 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDST3O95803 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDST3O95803 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDST3O95803 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NDST3O95803 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDST3O95803 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDST3O95803 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDST3O95803 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST3O95803 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST3O95803 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST3O95803 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST3O95803 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST3O95803 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST3O95803 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST3O95803 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST3O95803 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST3O95803 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST3O95803 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST3O95803 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST3O95803 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST3O95803 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST3O95803 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NDST3O95803 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDST3O95803 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDST3O95803 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDST3O95803 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDST3O95803 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDST3O95803 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDST3O95803 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDST3O95803 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NDST3O95803 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NDST3O95803 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDST3O95803 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDST3O95803 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDST3O95803 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDST3O95803 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDST3O95803 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDST3O95803 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDST3O95803 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDST3O95803 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDST3O95803 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDST3O95803 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NDST3O95803 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDST3O95803 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDST3O95803 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDST3O95803 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.6 ms