Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP29O95721 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP29O95721 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP29O95721 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP29O95721 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP29O95721 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP29O95721 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNAP29O95721 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNAP29O95721 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP29O95721 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP29O95721 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP29O95721 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP29O95721 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP29O95721 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP29O95721 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP29O95721 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP29O95721 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP29O95721 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP29O95721 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP29O95721 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.5 ms