Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNGR4O95473 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNGR4O95473 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNGR4O95473 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNGR4O95473 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNGR4O95473 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNGR4O95473 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNGR4O95473 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNGR4O95473 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNGR4O95473 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNGR4O95473 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNGR4O95473 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNGR4O95473 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNGR4O95473 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SYNGR4O95473 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SYNGR4O95473 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNGR4O95473 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNGR4O95473 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNGR4O95473 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNGR4O95473 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNGR4O95473 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNGR4O95473 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGR4O95473 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGR4O95473 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGR4O95473 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGR4O95473 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGR4O95473 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNGR4O95473 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNGR4O95473 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNGR4O95473 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNGR4O95473 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNGR4O95473 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNGR4O95473 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNGR4O95473 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNGR4O95473 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNGR4O95473 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNGR4O95473 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNGR4O95473 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNGR4O95473 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNGR4O95473 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNGR4O95473 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNGR4O95473 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNGR4O95473 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNGR4O95473 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNGR4O95473 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNGR4O95473 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNGR4O95473 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNGR4O95473 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNGR4O95473 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNGR4O95473 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNGR4O95473 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNGR4O95473 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms