Protein–RNA interactions for Protein: O95361

TRIM16, Tripartite motif-containing protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16O95361 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM16O95361 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM16O95361 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM16O95361 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM16O95361 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM16O95361 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM16O95361 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM16O95361 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM16O95361 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM16O95361 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM16O95361 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM16O95361 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM16O95361 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM16O95361 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM16O95361 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM16O95361 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM16O95361 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM16O95361 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM16O95361 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM16O95361 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM16O95361 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM16O95361 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM16O95361 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM16O95361 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM16O95361 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM16O95361 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM16O95361 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM16O95361 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM16O95361 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM16O95361 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM16O95361 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM16O95361 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM16O95361 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM16O95361 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM16O95361 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM16O95361 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM16O95361 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM16O95361 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM16O95361 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM16O95361 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM16O95361 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM16O95361 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM16O95361 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM16O95361 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM16O95361 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM16O95361 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM16O95361 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM16O95361 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM16O95361 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM16O95361 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM16O95361 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM16O95361 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM16O95361 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM16O95361 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM16O95361 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM16O95361 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM16O95361 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM16O95361 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM16O95361 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms