Protein–RNA interactions for Protein: O95150

TNFSF15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF15O95150 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF15O95150 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF15O95150 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF15O95150 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF15O95150 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF15O95150 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF15O95150 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF15O95150 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF15O95150 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF15O95150 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF15O95150 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF15O95150 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF15O95150 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF15O95150 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF15O95150 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNFSF15O95150 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFSF15O95150 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFSF15O95150 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF15O95150 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF15O95150 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF15O95150 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF15O95150 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF15O95150 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF15O95150 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF15O95150 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF15O95150 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF15O95150 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF15O95150 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF15O95150 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF15O95150 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF15O95150 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF15O95150 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF15O95150 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF15O95150 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF15O95150 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF15O95150 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF15O95150 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF15O95150 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF15O95150 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF15O95150 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF15O95150 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF15O95150 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF15O95150 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF15O95150 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF15O95150 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF15O95150 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF15O95150 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF15O95150 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF15O95150 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF15O95150 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF15O95150 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TNFSF15O95150 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF15O95150 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF15O95150 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF15O95150 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF15O95150 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF15O95150 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF15O95150 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF15O95150 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms