Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SLIT2O94813 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SLIT2O94813 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SLIT2O94813 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SLIT2O94813 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SLIT2O94813 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SLIT2O94813 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SLIT2O94813 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SLIT2O94813 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SLIT2O94813 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SLIT2O94813 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SLIT2O94813 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
SLIT2O94813 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SLIT2O94813 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SLIT2O94813 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SLIT2O94813 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SLIT2O94813 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SLIT2O94813 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SLIT2O94813 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SLIT2O94813 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SLIT2O94813 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SLIT2O94813 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SLIT2O94813 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
SLIT2O94813 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SLIT2O94813 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SLIT2O94813 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
SLIT2O94813 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SLIT2O94813 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
SLIT2O94813 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SLIT2O94813 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SLIT2O94813 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SLIT2O94813 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SLIT2O94813 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SLIT2O94813 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SLIT2O94813 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SLIT2O94813 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
SLIT2O94813 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SLIT2O94813 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SLIT2O94813 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SLIT2O94813 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
SLIT2O94813 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SLIT2O94813 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SLIT2O94813 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SLIT2O94813 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
SLIT2O94813 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SLIT2O94813 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SLIT2O94813 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SLIT2O94813 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SLIT2O94813 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SLIT2O94813 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SLIT2O94813 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SLIT2O94813 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
SLIT2O94813 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SLIT2O94813 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SLIT2O94813 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SLIT2O94813 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SLIT2O94813 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SLIT2O94813 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SLIT2O94813 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SLIT2O94813 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SLIT2O94813 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SLIT2O94813 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SLIT2O94813 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
SLIT2O94813 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SLIT2O94813 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SLIT2O94813 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SLIT2O94813 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SLIT2O94813 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SLIT2O94813 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SLIT2O94813 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SLIT2O94813 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
SLIT2O94813 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
SLIT2O94813 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SLIT2O94813 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SLIT2O94813 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
SLIT2O94813 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SLIT2O94813 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SLIT2O94813 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SLIT2O94813 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SLIT2O94813 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SLIT2O94813 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SLIT2O94813 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
SLIT2O94813 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SLIT2O94813 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SLIT2O94813 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SLIT2O94813 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
SLIT2O94813 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SLIT2O94813 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SLIT2O94813 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SLIT2O94813 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SLIT2O94813 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SLIT2O94813 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SLIT2O94813 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SLIT2O94813 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SLIT2O94813 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SLIT2O94813 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SLIT2O94813 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SLIT2O94813 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
SLIT2O94813 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SLIT2O94813 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms