Protein–RNA interactions for Protein: O75688

PPM1B, Protein phosphatase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1BO75688 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1BO75688 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1BO75688 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1BO75688 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1BO75688 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1BO75688 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1BO75688 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1BO75688 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1BO75688 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1BO75688 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1BO75688 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1BO75688 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1BO75688 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1BO75688 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1BO75688 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1BO75688 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1BO75688 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1BO75688 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1BO75688 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1BO75688 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1BO75688 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1BO75688 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1BO75688 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1BO75688 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1BO75688 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1BO75688 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1BO75688 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1BO75688 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1BO75688 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1BO75688 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1BO75688 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1BO75688 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1BO75688 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1BO75688 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1BO75688 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1BO75688 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1BO75688 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1BO75688 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1BO75688 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1BO75688 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1BO75688 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1BO75688 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1BO75688 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1BO75688 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1BO75688 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1BO75688 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPM1BO75688 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPM1BO75688 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPM1BO75688 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPM1BO75688 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPM1BO75688 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPM1BO75688 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPM1BO75688 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPM1BO75688 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPM1BO75688 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPM1BO75688 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPM1BO75688 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPM1BO75688 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPM1BO75688 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPM1BO75688 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPM1BO75688 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPM1BO75688 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPM1BO75688 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPM1BO75688 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPM1BO75688 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPM1BO75688 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPM1BO75688 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PPM1BO75688 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPM1BO75688 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PPM1BO75688 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPM1BO75688 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPM1BO75688 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPM1BO75688 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPM1BO75688 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPM1BO75688 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPM1BO75688 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPM1BO75688 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPM1BO75688 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPM1BO75688 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPM1BO75688 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PPM1BO75688 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPM1BO75688 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPM1BO75688 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPM1BO75688 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPM1BO75688 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPM1BO75688 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PPM1BO75688 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PPM1BO75688 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PPM1BO75688 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPM1BO75688 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPM1BO75688 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPM1BO75688 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPM1BO75688 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPM1BO75688 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPM1BO75688 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPM1BO75688 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPM1BO75688 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPM1BO75688 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPM1BO75688 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPM1BO75688 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms