Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCATO75600 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCATO75600 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCATO75600 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCATO75600 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCATO75600 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCATO75600 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCATO75600 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCATO75600 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCATO75600 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GCATO75600 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCATO75600 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCATO75600 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCATO75600 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCATO75600 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GCATO75600 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCATO75600 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GCATO75600 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCATO75600 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCATO75600 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCATO75600 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCATO75600 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCATO75600 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCATO75600 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCATO75600 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCATO75600 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCATO75600 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCATO75600 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCATO75600 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCATO75600 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCATO75600 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCATO75600 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCATO75600 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCATO75600 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCATO75600 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GCATO75600 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCATO75600 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCATO75600 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCATO75600 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCATO75600 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCATO75600 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCATO75600 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCATO75600 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GCATO75600 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCATO75600 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCATO75600 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCATO75600 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GCATO75600 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GCATO75600 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GCATO75600 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GCATO75600 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GCATO75600 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCATO75600 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCATO75600 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCATO75600 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCATO75600 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCATO75600 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCATO75600 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCATO75600 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GCATO75600 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCATO75600 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCATO75600 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCATO75600 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCATO75600 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCATO75600 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCATO75600 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCATO75600 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCATO75600 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCATO75600 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCATO75600 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCATO75600 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCATO75600 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCATO75600 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCATO75600 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GCATO75600 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCATO75600 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCATO75600 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCATO75600 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCATO75600 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCATO75600 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCATO75600 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCATO75600 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GCATO75600 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCATO75600 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCATO75600 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCATO75600 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCATO75600 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCATO75600 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCATO75600 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCATO75600 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCATO75600 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCATO75600 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCATO75600 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCATO75600 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCATO75600 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCATO75600 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCATO75600 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCATO75600 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCATO75600 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCATO75600 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms