Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NIPSNAP2O75323 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NIPSNAP2O75323 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NIPSNAP2O75323 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NIPSNAP2O75323 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NIPSNAP2O75323 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIPSNAP2O75323 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIPSNAP2O75323 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIPSNAP2O75323 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIPSNAP2O75323 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIPSNAP2O75323 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIPSNAP2O75323 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP2O75323 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP2O75323 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP2O75323 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP2O75323 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP2O75323 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP2O75323 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP2O75323 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP2O75323 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP2O75323 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP2O75323 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP2O75323 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP2O75323 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIPSNAP2O75323 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIPSNAP2O75323 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIPSNAP2O75323 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIPSNAP2O75323 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIPSNAP2O75323 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIPSNAP2O75323 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NIPSNAP2O75323 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NIPSNAP2O75323 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NIPSNAP2O75323 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NIPSNAP2O75323 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NIPSNAP2O75323 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIPSNAP2O75323 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIPSNAP2O75323 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIPSNAP2O75323 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIPSNAP2O75323 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIPSNAP2O75323 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIPSNAP2O75323 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NIPSNAP2O75323 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NIPSNAP2O75323 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NIPSNAP2O75323 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NIPSNAP2O75323 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NIPSNAP2O75323 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NIPSNAP2O75323 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NIPSNAP2O75323 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NIPSNAP2O75323 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NIPSNAP2O75323 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NIPSNAP2O75323 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NIPSNAP2O75323 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIPSNAP2O75323 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIPSNAP2O75323 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIPSNAP2O75323 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIPSNAP2O75323 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NIPSNAP2O75323 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIPSNAP2O75323 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIPSNAP2O75323 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIPSNAP2O75323 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIPSNAP2O75323 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIPSNAP2O75323 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIPSNAP2O75323 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIPSNAP2O75323 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NIPSNAP2O75323 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NIPSNAP2O75323 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NIPSNAP2O75323 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NIPSNAP2O75323 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NIPSNAP2O75323 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NIPSNAP2O75323 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NIPSNAP2O75323 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIPSNAP2O75323 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIPSNAP2O75323 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIPSNAP2O75323 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIPSNAP2O75323 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIPSNAP2O75323 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIPSNAP2O75323 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIPSNAP2O75323 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NIPSNAP2O75323 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NIPSNAP2O75323 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIPSNAP2O75323 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NIPSNAP2O75323 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIPSNAP2O75323 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIPSNAP2O75323 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIPSNAP2O75323 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIPSNAP2O75323 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIPSNAP2O75323 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIPSNAP2O75323 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIPSNAP2O75323 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NIPSNAP2O75323 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIPSNAP2O75323 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIPSNAP2O75323 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms