Protein–RNA interactions for Protein: O75140

DEPDC5, GATOR complex protein DEPDC5, humanhuman

Predictions only

Length 1,603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC5O75140 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
DEPDC5O75140 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
DEPDC5O75140 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
DEPDC5O75140 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
DEPDC5O75140 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
DEPDC5O75140 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
DEPDC5O75140 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
DEPDC5O75140 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
DEPDC5O75140 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
DEPDC5O75140 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
DEPDC5O75140 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
DEPDC5O75140 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
DEPDC5O75140 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
DEPDC5O75140 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
DEPDC5O75140 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
DEPDC5O75140 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
DEPDC5O75140 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
DEPDC5O75140 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
DEPDC5O75140 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
DEPDC5O75140 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
DEPDC5O75140 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
DEPDC5O75140 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
DEPDC5O75140 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
DEPDC5O75140 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
DEPDC5O75140 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
DEPDC5O75140 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
DEPDC5O75140 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
DEPDC5O75140 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
DEPDC5O75140 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
DEPDC5O75140 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
DEPDC5O75140 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
DEPDC5O75140 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
DEPDC5O75140 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
DEPDC5O75140 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
DEPDC5O75140 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
DEPDC5O75140 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
DEPDC5O75140 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
DEPDC5O75140 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
DEPDC5O75140 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
DEPDC5O75140 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
DEPDC5O75140 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
DEPDC5O75140 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
DEPDC5O75140 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
DEPDC5O75140 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
DEPDC5O75140 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
DEPDC5O75140 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
DEPDC5O75140 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
DEPDC5O75140 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
DEPDC5O75140 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
DEPDC5O75140 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
DEPDC5O75140 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
DEPDC5O75140 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
DEPDC5O75140 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
DEPDC5O75140 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
DEPDC5O75140 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
DEPDC5O75140 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
DEPDC5O75140 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
DEPDC5O75140 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
DEPDC5O75140 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
DEPDC5O75140 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
DEPDC5O75140 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
DEPDC5O75140 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
DEPDC5O75140 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
DEPDC5O75140 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
DEPDC5O75140 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
DEPDC5O75140 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
DEPDC5O75140 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
DEPDC5O75140 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
DEPDC5O75140 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
DEPDC5O75140 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
DEPDC5O75140 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
DEPDC5O75140 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
DEPDC5O75140 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
DEPDC5O75140 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
DEPDC5O75140 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
DEPDC5O75140 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
DEPDC5O75140 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
DEPDC5O75140 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
DEPDC5O75140 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
DEPDC5O75140 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
DEPDC5O75140 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
DEPDC5O75140 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
DEPDC5O75140 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
DEPDC5O75140 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
DEPDC5O75140 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
DEPDC5O75140 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
DEPDC5O75140 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
DEPDC5O75140 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
DEPDC5O75140 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
DEPDC5O75140 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC36.39■■■■□ 3.42
DEPDC5O75140 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
DEPDC5O75140 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
DEPDC5O75140 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
DEPDC5O75140 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
DEPDC5O75140 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
DEPDC5O75140 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
DEPDC5O75140 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
DEPDC5O75140 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
DEPDC5O75140 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
DEPDC5O75140 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 390.4 ms