Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBNO60934 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBNO60934 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NBNO60934 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBNO60934 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBNO60934 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBNO60934 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBNO60934 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBNO60934 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBNO60934 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBNO60934 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBNO60934 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBNO60934 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBNO60934 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBNO60934 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBNO60934 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBNO60934 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBNO60934 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NBNO60934 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NBNO60934 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
NBNO60934 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NBNO60934 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBNO60934 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBNO60934 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NBNO60934 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NBNO60934 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBNO60934 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBNO60934 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBNO60934 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBNO60934 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBNO60934 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBNO60934 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBNO60934 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBNO60934 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBNO60934 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NBNO60934 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBNO60934 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBNO60934 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBNO60934 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NBNO60934 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NBNO60934 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NBNO60934 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBNO60934 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBNO60934 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBNO60934 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBNO60934 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBNO60934 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBNO60934 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBNO60934 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBNO60934 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBNO60934 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NBNO60934 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NBNO60934 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NBNO60934 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NBNO60934 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NBNO60934 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NBNO60934 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NBNO60934 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NBNO60934 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NBNO60934 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NBNO60934 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NBNO60934 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NBNO60934 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NBNO60934 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NBNO60934 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NBNO60934 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NBNO60934 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NBNO60934 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NBNO60934 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NBNO60934 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NBNO60934 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NBNO60934 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NBNO60934 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NBNO60934 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NBNO60934 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NBNO60934 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NBNO60934 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NBNO60934 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NBNO60934 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NBNO60934 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBNO60934 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBNO60934 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBNO60934 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBNO60934 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBNO60934 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBNO60934 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBNO60934 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NBNO60934 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBNO60934 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBNO60934 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBNO60934 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBNO60934 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBNO60934 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBNO60934 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBNO60934 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBNO60934 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBNO60934 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NBNO60934 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBNO60934 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBNO60934 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms