Protein–RNA interactions for Protein: O60687

SRPX2, Sushi repeat-containing protein SRPX2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPX2O60687 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPX2O60687 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPX2O60687 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPX2O60687 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPX2O60687 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPX2O60687 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPX2O60687 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPX2O60687 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPX2O60687 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPX2O60687 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPX2O60687 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRPX2O60687 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPX2O60687 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPX2O60687 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPX2O60687 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPX2O60687 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPX2O60687 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPX2O60687 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPX2O60687 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPX2O60687 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPX2O60687 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPX2O60687 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPX2O60687 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPX2O60687 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPX2O60687 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPX2O60687 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPX2O60687 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPX2O60687 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPX2O60687 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPX2O60687 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPX2O60687 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPX2O60687 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPX2O60687 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPX2O60687 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPX2O60687 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPX2O60687 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPX2O60687 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPX2O60687 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPX2O60687 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPX2O60687 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPX2O60687 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPX2O60687 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPX2O60687 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPX2O60687 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPX2O60687 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPX2O60687 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPX2O60687 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPX2O60687 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms