Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MSCO60682 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MSCO60682 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MSCO60682 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MSCO60682 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MSCO60682 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MSCO60682 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MSCO60682 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MSCO60682 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MSCO60682 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MSCO60682 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MSCO60682 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSCO60682 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSCO60682 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSCO60682 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSCO60682 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSCO60682 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSCO60682 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSCO60682 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSCO60682 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MSCO60682 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MSCO60682 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MSCO60682 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MSCO60682 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MSCO60682 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MSCO60682 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MSCO60682 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MSCO60682 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MSCO60682 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MSCO60682 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MSCO60682 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSCO60682 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSCO60682 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSCO60682 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSCO60682 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSCO60682 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSCO60682 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MSCO60682 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MSCO60682 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MSCO60682 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MSCO60682 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MSCO60682 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MSCO60682 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MSCO60682 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MSCO60682 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MSCO60682 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MSCO60682 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MSCO60682 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MSCO60682 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MSCO60682 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MSCO60682 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MSCO60682 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MSCO60682 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MSCO60682 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MSCO60682 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MSCO60682 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MSCO60682 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MSCO60682 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MSCO60682 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MSCO60682 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MSCO60682 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MSCO60682 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MSCO60682 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MSCO60682 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MSCO60682 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MSCO60682 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MSCO60682 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MSCO60682 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MSCO60682 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MSCO60682 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MSCO60682 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MSCO60682 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MSCO60682 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MSCO60682 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MSCO60682 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MSCO60682 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MSCO60682 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MSCO60682 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MSCO60682 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MSCO60682 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MSCO60682 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MSCO60682 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MSCO60682 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MSCO60682 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MSCO60682 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MSCO60682 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MSCO60682 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MSCO60682 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MSCO60682 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSCO60682 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSCO60682 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSCO60682 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSCO60682 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSCO60682 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSCO60682 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSCO60682 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MSCO60682 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MSCO60682 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MSCO60682 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MSCO60682 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms