Protein–RNA interactions for Protein: O60603

TLR2, Toll-like receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR2O60603 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TLR2O60603 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TLR2O60603 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TLR2O60603 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TLR2O60603 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TLR2O60603 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TLR2O60603 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TLR2O60603 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TLR2O60603 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TLR2O60603 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TLR2O60603 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TLR2O60603 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TLR2O60603 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TLR2O60603 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TLR2O60603 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TLR2O60603 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TLR2O60603 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TLR2O60603 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TLR2O60603 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TLR2O60603 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TLR2O60603 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TLR2O60603 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TLR2O60603 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TLR2O60603 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TLR2O60603 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TLR2O60603 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TLR2O60603 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TLR2O60603 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TLR2O60603 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TLR2O60603 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TLR2O60603 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TLR2O60603 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TLR2O60603 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TLR2O60603 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TLR2O60603 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TLR2O60603 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TLR2O60603 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TLR2O60603 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TLR2O60603 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TLR2O60603 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TLR2O60603 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TLR2O60603 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TLR2O60603 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TLR2O60603 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TLR2O60603 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TLR2O60603 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TLR2O60603 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TLR2O60603 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TLR2O60603 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TLR2O60603 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TLR2O60603 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TLR2O60603 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TLR2O60603 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TLR2O60603 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TLR2O60603 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TLR2O60603 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TLR2O60603 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TLR2O60603 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TLR2O60603 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TLR2O60603 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TLR2O60603 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TLR2O60603 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TLR2O60603 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TLR2O60603 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TLR2O60603 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TLR2O60603 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TLR2O60603 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TLR2O60603 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TLR2O60603 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TLR2O60603 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TLR2O60603 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TLR2O60603 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TLR2O60603 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TLR2O60603 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TLR2O60603 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TLR2O60603 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TLR2O60603 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TLR2O60603 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TLR2O60603 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TLR2O60603 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TLR2O60603 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TLR2O60603 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TLR2O60603 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TLR2O60603 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TLR2O60603 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TLR2O60603 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TLR2O60603 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TLR2O60603 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TLR2O60603 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TLR2O60603 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TLR2O60603 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TLR2O60603 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TLR2O60603 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TLR2O60603 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TLR2O60603 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TLR2O60603 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TLR2O60603 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TLR2O60603 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TLR2O60603 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TLR2O60603 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms