Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PLXNC1O60486 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PLXNC1O60486 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
PLXNC1O60486 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
PLXNC1O60486 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
PLXNC1O60486 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
PLXNC1O60486 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PLXNC1O60486 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PLXNC1O60486 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PLXNC1O60486 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PLXNC1O60486 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PLXNC1O60486 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PLXNC1O60486 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PLXNC1O60486 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
PLXNC1O60486 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
PLXNC1O60486 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PLXNC1O60486 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PLXNC1O60486 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PLXNC1O60486 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PLXNC1O60486 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
PLXNC1O60486 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PLXNC1O60486 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
PLXNC1O60486 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PLXNC1O60486 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PLXNC1O60486 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PLXNC1O60486 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PLXNC1O60486 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PLXNC1O60486 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PLXNC1O60486 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PLXNC1O60486 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PLXNC1O60486 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PLXNC1O60486 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PLXNC1O60486 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PLXNC1O60486 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PLXNC1O60486 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PLXNC1O60486 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PLXNC1O60486 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PLXNC1O60486 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PLXNC1O60486 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PLXNC1O60486 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PLXNC1O60486 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PLXNC1O60486 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PLXNC1O60486 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PLXNC1O60486 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PLXNC1O60486 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PLXNC1O60486 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PLXNC1O60486 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PLXNC1O60486 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PLXNC1O60486 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
PLXNC1O60486 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.13■■■■□ 3.53
PLXNC1O60486 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.13■■■■□ 3.53
PLXNC1O60486 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PLXNC1O60486 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
PLXNC1O60486 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
PLXNC1O60486 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PLXNC1O60486 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PLXNC1O60486 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
PLXNC1O60486 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PLXNC1O60486 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PLXNC1O60486 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PLXNC1O60486 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PLXNC1O60486 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PLXNC1O60486 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PLXNC1O60486 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PLXNC1O60486 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PLXNC1O60486 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
PLXNC1O60486 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PLXNC1O60486 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PLXNC1O60486 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PLXNC1O60486 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PLXNC1O60486 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PLXNC1O60486 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PLXNC1O60486 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PLXNC1O60486 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PLXNC1O60486 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PLXNC1O60486 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PLXNC1O60486 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PLXNC1O60486 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PLXNC1O60486 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PLXNC1O60486 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PLXNC1O60486 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PLXNC1O60486 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PLXNC1O60486 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PLXNC1O60486 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PLXNC1O60486 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PLXNC1O60486 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PLXNC1O60486 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PLXNC1O60486 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PLXNC1O60486 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PLXNC1O60486 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PLXNC1O60486 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PLXNC1O60486 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PLXNC1O60486 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PLXNC1O60486 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PLXNC1O60486 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
PLXNC1O60486 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PLXNC1O60486 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
PLXNC1O60486 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
PLXNC1O60486 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PLXNC1O60486 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms