Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PPLO60437 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PPLO60437 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PPLO60437 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PPLO60437 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PPLO60437 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PPLO60437 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PPLO60437 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PPLO60437 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PPLO60437 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PPLO60437 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
PPLO60437 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PPLO60437 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PPLO60437 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PPLO60437 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PPLO60437 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PPLO60437 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PPLO60437 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
PPLO60437 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PPLO60437 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PPLO60437 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PPLO60437 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PPLO60437 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PPLO60437 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PPLO60437 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PPLO60437 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PPLO60437 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PPLO60437 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
PPLO60437 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PPLO60437 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PPLO60437 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PPLO60437 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PPLO60437 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PPLO60437 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PPLO60437 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
PPLO60437 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PPLO60437 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PPLO60437 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PPLO60437 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PPLO60437 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PPLO60437 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PPLO60437 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PPLO60437 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
PPLO60437 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PPLO60437 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PPLO60437 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PPLO60437 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PPLO60437 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PPLO60437 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PPLO60437 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PPLO60437 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
PPLO60437 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PPLO60437 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PPLO60437 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PPLO60437 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PPLO60437 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PPLO60437 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
PPLO60437 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
PPLO60437 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
PPLO60437 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
PPLO60437 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PPLO60437 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PPLO60437 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PPLO60437 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PPLO60437 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PPLO60437 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PPLO60437 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PPLO60437 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PPLO60437 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PPLO60437 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PPLO60437 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PPLO60437 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PPLO60437 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PPLO60437 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PPLO60437 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PPLO60437 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PPLO60437 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PPLO60437 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PPLO60437 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PPLO60437 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PPLO60437 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PPLO60437 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PPLO60437 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PPLO60437 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PPLO60437 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PPLO60437 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PPLO60437 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PPLO60437 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PPLO60437 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PPLO60437 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PPLO60437 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PPLO60437 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PPLO60437 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PPLO60437 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PPLO60437 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PPLO60437 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PPLO60437 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PPLO60437 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PPLO60437 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PPLO60437 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms