Protein–RNA interactions for Protein: O60343

TBC1D4, TBC1 domain family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D4O60343 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TBC1D4O60343 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TBC1D4O60343 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TBC1D4O60343 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TBC1D4O60343 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TBC1D4O60343 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TBC1D4O60343 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TBC1D4O60343 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TBC1D4O60343 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TBC1D4O60343 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TBC1D4O60343 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TBC1D4O60343 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TBC1D4O60343 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TBC1D4O60343 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TBC1D4O60343 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TBC1D4O60343 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TBC1D4O60343 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TBC1D4O60343 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TBC1D4O60343 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TBC1D4O60343 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TBC1D4O60343 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TBC1D4O60343 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TBC1D4O60343 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TBC1D4O60343 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TBC1D4O60343 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TBC1D4O60343 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TBC1D4O60343 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TBC1D4O60343 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TBC1D4O60343 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TBC1D4O60343 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TBC1D4O60343 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TBC1D4O60343 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TBC1D4O60343 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TBC1D4O60343 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TBC1D4O60343 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TBC1D4O60343 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TBC1D4O60343 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TBC1D4O60343 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TBC1D4O60343 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TBC1D4O60343 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TBC1D4O60343 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TBC1D4O60343 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TBC1D4O60343 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TBC1D4O60343 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TBC1D4O60343 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TBC1D4O60343 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TBC1D4O60343 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TBC1D4O60343 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TBC1D4O60343 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TBC1D4O60343 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TBC1D4O60343 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TBC1D4O60343 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TBC1D4O60343 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TBC1D4O60343 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TBC1D4O60343 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TBC1D4O60343 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TBC1D4O60343 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TBC1D4O60343 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TBC1D4O60343 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TBC1D4O60343 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TBC1D4O60343 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TBC1D4O60343 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TBC1D4O60343 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBC1D4O60343 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBC1D4O60343 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBC1D4O60343 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBC1D4O60343 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBC1D4O60343 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBC1D4O60343 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBC1D4O60343 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TBC1D4O60343 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBC1D4O60343 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBC1D4O60343 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TBC1D4O60343 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TBC1D4O60343 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TBC1D4O60343 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TBC1D4O60343 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TBC1D4O60343 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TBC1D4O60343 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TBC1D4O60343 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TBC1D4O60343 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TBC1D4O60343 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TBC1D4O60343 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TBC1D4O60343 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TBC1D4O60343 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TBC1D4O60343 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TBC1D4O60343 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TBC1D4O60343 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TBC1D4O60343 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TBC1D4O60343 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TBC1D4O60343 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TBC1D4O60343 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TBC1D4O60343 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TBC1D4O60343 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TBC1D4O60343 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TBC1D4O60343 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TBC1D4O60343 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TBC1D4O60343 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TBC1D4O60343 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TBC1D4O60343 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
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