Protein–RNA interactions for Protein: O60315

ZEB2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB2O60315 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ZEB2O60315 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ZEB2O60315 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZEB2O60315 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZEB2O60315 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZEB2O60315 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZEB2O60315 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZEB2O60315 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZEB2O60315 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ZEB2O60315 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZEB2O60315 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZEB2O60315 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ZEB2O60315 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ZEB2O60315 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZEB2O60315 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZEB2O60315 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZEB2O60315 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZEB2O60315 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZEB2O60315 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZEB2O60315 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZEB2O60315 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZEB2O60315 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZEB2O60315 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZEB2O60315 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZEB2O60315 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZEB2O60315 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZEB2O60315 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZEB2O60315 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZEB2O60315 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZEB2O60315 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZEB2O60315 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZEB2O60315 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZEB2O60315 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZEB2O60315 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZEB2O60315 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZEB2O60315 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZEB2O60315 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZEB2O60315 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ZEB2O60315 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZEB2O60315 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZEB2O60315 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZEB2O60315 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZEB2O60315 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZEB2O60315 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZEB2O60315 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ZEB2O60315 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZEB2O60315 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZEB2O60315 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZEB2O60315 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZEB2O60315 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZEB2O60315 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZEB2O60315 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZEB2O60315 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZEB2O60315 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZEB2O60315 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZEB2O60315 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZEB2O60315 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZEB2O60315 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZEB2O60315 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZEB2O60315 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZEB2O60315 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ZEB2O60315 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZEB2O60315 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZEB2O60315 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZEB2O60315 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms