Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BNIP3LO60238 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BNIP3LO60238 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BNIP3LO60238 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BNIP3LO60238 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BNIP3LO60238 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BNIP3LO60238 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BNIP3LO60238 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BNIP3LO60238 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BNIP3LO60238 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BNIP3LO60238 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BNIP3LO60238 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BNIP3LO60238 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BNIP3LO60238 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BNIP3LO60238 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BNIP3LO60238 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BNIP3LO60238 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BNIP3LO60238 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BNIP3LO60238 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BNIP3LO60238 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BNIP3LO60238 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BNIP3LO60238 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BNIP3LO60238 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BNIP3LO60238 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BNIP3LO60238 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BNIP3LO60238 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BNIP3LO60238 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BNIP3LO60238 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BNIP3LO60238 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BNIP3LO60238 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BNIP3LO60238 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BNIP3LO60238 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BNIP3LO60238 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BNIP3LO60238 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BNIP3LO60238 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BNIP3LO60238 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BNIP3LO60238 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BNIP3LO60238 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BNIP3LO60238 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms