Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAD21O60216 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAD21O60216 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RAD21O60216 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAD21O60216 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAD21O60216 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAD21O60216 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAD21O60216 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAD21O60216 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAD21O60216 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAD21O60216 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAD21O60216 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAD21O60216 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAD21O60216 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAD21O60216 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAD21O60216 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAD21O60216 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAD21O60216 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAD21O60216 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAD21O60216 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAD21O60216 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAD21O60216 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAD21O60216 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAD21O60216 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAD21O60216 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAD21O60216 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAD21O60216 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAD21O60216 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAD21O60216 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAD21O60216 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAD21O60216 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAD21O60216 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAD21O60216 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAD21O60216 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAD21O60216 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAD21O60216 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAD21O60216 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAD21O60216 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RAD21O60216 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAD21O60216 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAD21O60216 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAD21O60216 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAD21O60216 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAD21O60216 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAD21O60216 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RAD21O60216 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAD21O60216 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RAD21O60216 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAD21O60216 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAD21O60216 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAD21O60216 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAD21O60216 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAD21O60216 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAD21O60216 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAD21O60216 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAD21O60216 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAD21O60216 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAD21O60216 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAD21O60216 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAD21O60216 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RAD21O60216 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
RAD21O60216 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
RAD21O60216 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RAD21O60216 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RAD21O60216 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RAD21O60216 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAD21O60216 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAD21O60216 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAD21O60216 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RAD21O60216 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAD21O60216 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAD21O60216 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAD21O60216 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAD21O60216 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAD21O60216 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAD21O60216 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAD21O60216 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAD21O60216 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAD21O60216 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAD21O60216 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAD21O60216 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAD21O60216 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAD21O60216 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAD21O60216 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAD21O60216 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAD21O60216 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAD21O60216 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAD21O60216 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAD21O60216 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAD21O60216 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAD21O60216 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAD21O60216 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAD21O60216 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAD21O60216 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAD21O60216 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAD21O60216 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RAD21O60216 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAD21O60216 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAD21O60216 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAD21O60216 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms