Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VEGFDO43915 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VEGFDO43915 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VEGFDO43915 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
VEGFDO43915 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VEGFDO43915 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VEGFDO43915 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VEGFDO43915 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VEGFDO43915 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VEGFDO43915 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VEGFDO43915 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VEGFDO43915 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VEGFDO43915 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VEGFDO43915 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VEGFDO43915 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VEGFDO43915 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VEGFDO43915 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VEGFDO43915 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VEGFDO43915 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VEGFDO43915 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VEGFDO43915 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VEGFDO43915 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms