Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRICKLE3O43900 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRICKLE3O43900 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRICKLE3O43900 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRICKLE3O43900 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRICKLE3O43900 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRICKLE3O43900 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRICKLE3O43900 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRICKLE3O43900 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRICKLE3O43900 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRICKLE3O43900 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRICKLE3O43900 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRICKLE3O43900 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRICKLE3O43900 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRICKLE3O43900 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRICKLE3O43900 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRICKLE3O43900 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRICKLE3O43900 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRICKLE3O43900 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRICKLE3O43900 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRICKLE3O43900 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRICKLE3O43900 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRICKLE3O43900 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRICKLE3O43900 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRICKLE3O43900 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRICKLE3O43900 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRICKLE3O43900 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRICKLE3O43900 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRICKLE3O43900 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRICKLE3O43900 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRICKLE3O43900 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRICKLE3O43900 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRICKLE3O43900 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRICKLE3O43900 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRICKLE3O43900 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRICKLE3O43900 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms