Protein–RNA interactions for Protein: O43795

MYO1B, Unconventional myosin-Ib, humanhuman

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1BO43795 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MYO1BO43795 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MYO1BO43795 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
MYO1BO43795 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MYO1BO43795 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
MYO1BO43795 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MYO1BO43795 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MYO1BO43795 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MYO1BO43795 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MYO1BO43795 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MYO1BO43795 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
MYO1BO43795 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
MYO1BO43795 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MYO1BO43795 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MYO1BO43795 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MYO1BO43795 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MYO1BO43795 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MYO1BO43795 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MYO1BO43795 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MYO1BO43795 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MYO1BO43795 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MYO1BO43795 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MYO1BO43795 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MYO1BO43795 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MYO1BO43795 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MYO1BO43795 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MYO1BO43795 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MYO1BO43795 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MYO1BO43795 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MYO1BO43795 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MYO1BO43795 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MYO1BO43795 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MYO1BO43795 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MYO1BO43795 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MYO1BO43795 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MYO1BO43795 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MYO1BO43795 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MYO1BO43795 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MYO1BO43795 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
MYO1BO43795 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
MYO1BO43795 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MYO1BO43795 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MYO1BO43795 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MYO1BO43795 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MYO1BO43795 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MYO1BO43795 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MYO1BO43795 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MYO1BO43795 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MYO1BO43795 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MYO1BO43795 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
MYO1BO43795 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MYO1BO43795 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MYO1BO43795 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MYO1BO43795 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MYO1BO43795 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MYO1BO43795 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MYO1BO43795 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MYO1BO43795 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MYO1BO43795 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
MYO1BO43795 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
MYO1BO43795 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MYO1BO43795 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MYO1BO43795 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MYO1BO43795 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MYO1BO43795 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MYO1BO43795 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MYO1BO43795 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MYO1BO43795 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MYO1BO43795 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
MYO1BO43795 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MYO1BO43795 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MYO1BO43795 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MYO1BO43795 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
MYO1BO43795 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MYO1BO43795 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MYO1BO43795 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MYO1BO43795 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MYO1BO43795 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MYO1BO43795 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MYO1BO43795 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
MYO1BO43795 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MYO1BO43795 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MYO1BO43795 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MYO1BO43795 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MYO1BO43795 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MYO1BO43795 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MYO1BO43795 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MYO1BO43795 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MYO1BO43795 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MYO1BO43795 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MYO1BO43795 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MYO1BO43795 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MYO1BO43795 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MYO1BO43795 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MYO1BO43795 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
MYO1BO43795 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MYO1BO43795 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MYO1BO43795 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MYO1BO43795 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MYO1BO43795 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms