Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLX3O43711 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLX3O43711 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLX3O43711 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLX3O43711 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TLX3O43711 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLX3O43711 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLX3O43711 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLX3O43711 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLX3O43711 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLX3O43711 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLX3O43711 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLX3O43711 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLX3O43711 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLX3O43711 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLX3O43711 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLX3O43711 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TLX3O43711 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLX3O43711 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLX3O43711 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLX3O43711 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLX3O43711 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLX3O43711 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLX3O43711 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLX3O43711 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLX3O43711 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLX3O43711 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLX3O43711 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLX3O43711 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLX3O43711 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLX3O43711 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLX3O43711 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLX3O43711 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLX3O43711 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLX3O43711 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLX3O43711 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLX3O43711 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLX3O43711 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TLX3O43711 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLX3O43711 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLX3O43711 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLX3O43711 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLX3O43711 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLX3O43711 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLX3O43711 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TLX3O43711 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLX3O43711 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLX3O43711 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLX3O43711 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TLX3O43711 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLX3O43711 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLX3O43711 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLX3O43711 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLX3O43711 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLX3O43711 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLX3O43711 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLX3O43711 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLX3O43711 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLX3O43711 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLX3O43711 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLX3O43711 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLX3O43711 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLX3O43711 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLX3O43711 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLX3O43711 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLX3O43711 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLX3O43711 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLX3O43711 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLX3O43711 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLX3O43711 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TLX3O43711 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TLX3O43711 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLX3O43711 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLX3O43711 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLX3O43711 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLX3O43711 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLX3O43711 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLX3O43711 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLX3O43711 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLX3O43711 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLX3O43711 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLX3O43711 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLX3O43711 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TLX3O43711 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLX3O43711 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLX3O43711 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLX3O43711 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLX3O43711 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLX3O43711 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLX3O43711 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLX3O43711 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLX3O43711 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLX3O43711 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLX3O43711 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLX3O43711 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLX3O43711 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TLX3O43711 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLX3O43711 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLX3O43711 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLX3O43711 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms