Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNFSF14O43557 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFSF14O43557 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
TNFSF14O43557 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNFSF14O43557 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNFSF14O43557 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNFSF14O43557 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNFSF14O43557 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFSF14O43557 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFSF14O43557 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFSF14O43557 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms