Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLDN3O15551 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLDN3O15551 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLDN3O15551 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLDN3O15551 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLDN3O15551 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLDN3O15551 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CLDN3O15551 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLDN3O15551 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLDN3O15551 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLDN3O15551 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLDN3O15551 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLDN3O15551 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLDN3O15551 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLDN3O15551 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLDN3O15551 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLDN3O15551 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLDN3O15551 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLDN3O15551 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLDN3O15551 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLDN3O15551 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLDN3O15551 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLDN3O15551 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CLDN3O15551 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLDN3O15551 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLDN3O15551 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLDN3O15551 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLDN3O15551 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLDN3O15551 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLDN3O15551 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CLDN3O15551 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLDN3O15551 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLDN3O15551 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLDN3O15551 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLDN3O15551 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLDN3O15551 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLDN3O15551 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLDN3O15551 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CLDN3O15551 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLDN3O15551 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLDN3O15551 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLDN3O15551 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLDN3O15551 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CLDN3O15551 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLDN3O15551 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLDN3O15551 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLDN3O15551 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CLDN3O15551 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLDN3O15551 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLDN3O15551 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLDN3O15551 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLDN3O15551 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLDN3O15551 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLDN3O15551 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLDN3O15551 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CLDN3O15551 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLDN3O15551 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLDN3O15551 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLDN3O15551 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CLDN3O15551 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLDN3O15551 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLDN3O15551 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CLDN3O15551 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLDN3O15551 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms