Protein–RNA interactions for Protein: O15344

MID1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1O15344 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MID1O15344 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MID1O15344 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MID1O15344 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MID1O15344 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MID1O15344 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MID1O15344 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MID1O15344 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MID1O15344 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MID1O15344 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MID1O15344 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MID1O15344 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MID1O15344 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MID1O15344 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MID1O15344 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MID1O15344 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MID1O15344 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MID1O15344 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MID1O15344 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MID1O15344 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MID1O15344 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MID1O15344 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MID1O15344 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MID1O15344 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MID1O15344 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MID1O15344 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MID1O15344 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MID1O15344 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MID1O15344 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MID1O15344 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MID1O15344 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MID1O15344 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MID1O15344 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MID1O15344 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MID1O15344 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MID1O15344 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MID1O15344 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MID1O15344 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MID1O15344 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MID1O15344 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MID1O15344 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MID1O15344 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MID1O15344 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MID1O15344 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MID1O15344 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MID1O15344 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MID1O15344 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MID1O15344 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MID1O15344 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MID1O15344 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MID1O15344 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MID1O15344 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MID1O15344 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MID1O15344 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MID1O15344 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MID1O15344 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MID1O15344 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MID1O15344 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MID1O15344 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MID1O15344 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MID1O15344 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MID1O15344 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MID1O15344 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MID1O15344 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MID1O15344 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MID1O15344 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MID1O15344 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MID1O15344 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MID1O15344 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MID1O15344 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MID1O15344 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MID1O15344 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MID1O15344 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MID1O15344 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MID1O15344 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MID1O15344 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MID1O15344 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MID1O15344 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MID1O15344 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MID1O15344 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MID1O15344 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MID1O15344 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MID1O15344 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MID1O15344 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MID1O15344 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MID1O15344 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MID1O15344 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MID1O15344 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MID1O15344 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MID1O15344 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MID1O15344 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MID1O15344 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MID1O15344 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MID1O15344 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MID1O15344 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MID1O15344 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MID1O15344 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MID1O15344 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MID1O15344 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MID1O15344 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms