Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHUKO15111 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHUKO15111 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHUKO15111 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHUKO15111 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHUKO15111 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHUKO15111 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHUKO15111 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHUKO15111 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHUKO15111 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHUKO15111 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHUKO15111 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHUKO15111 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHUKO15111 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHUKO15111 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHUKO15111 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHUKO15111 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHUKO15111 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHUKO15111 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHUKO15111 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHUKO15111 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHUKO15111 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHUKO15111 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHUKO15111 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHUKO15111 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHUKO15111 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHUKO15111 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHUKO15111 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHUKO15111 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHUKO15111 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHUKO15111 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHUKO15111 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHUKO15111 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHUKO15111 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHUKO15111 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHUKO15111 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHUKO15111 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHUKO15111 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHUKO15111 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHUKO15111 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHUKO15111 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHUKO15111 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHUKO15111 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CHUKO15111 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHUKO15111 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHUKO15111 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHUKO15111 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHUKO15111 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHUKO15111 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHUKO15111 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHUKO15111 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CHUKO15111 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHUKO15111 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHUKO15111 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHUKO15111 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHUKO15111 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHUKO15111 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHUKO15111 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHUKO15111 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHUKO15111 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHUKO15111 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHUKO15111 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHUKO15111 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHUKO15111 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHUKO15111 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHUKO15111 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHUKO15111 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHUKO15111 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHUKO15111 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHUKO15111 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHUKO15111 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHUKO15111 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHUKO15111 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHUKO15111 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHUKO15111 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHUKO15111 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHUKO15111 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHUKO15111 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHUKO15111 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHUKO15111 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHUKO15111 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHUKO15111 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHUKO15111 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHUKO15111 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHUKO15111 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHUKO15111 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHUKO15111 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHUKO15111 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHUKO15111 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHUKO15111 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHUKO15111 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHUKO15111 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHUKO15111 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHUKO15111 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHUKO15111 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHUKO15111 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHUKO15111 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHUKO15111 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHUKO15111 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHUKO15111 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms