Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
SETD1AO15047 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SETD1AO15047 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SETD1AO15047 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SETD1AO15047 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
SETD1AO15047 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SETD1AO15047 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SETD1AO15047 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SETD1AO15047 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SETD1AO15047 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SETD1AO15047 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SETD1AO15047 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SETD1AO15047 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SETD1AO15047 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SETD1AO15047 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SETD1AO15047 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SETD1AO15047 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
SETD1AO15047 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
SETD1AO15047 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
SETD1AO15047 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SETD1AO15047 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SETD1AO15047 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SETD1AO15047 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
SETD1AO15047 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SETD1AO15047 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SETD1AO15047 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SETD1AO15047 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SETD1AO15047 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SETD1AO15047 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SETD1AO15047 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SETD1AO15047 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SETD1AO15047 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SETD1AO15047 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SETD1AO15047 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SETD1AO15047 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SETD1AO15047 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SETD1AO15047 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SETD1AO15047 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
SETD1AO15047 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
SETD1AO15047 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
SETD1AO15047 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SETD1AO15047 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SETD1AO15047 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SETD1AO15047 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SETD1AO15047 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SETD1AO15047 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SETD1AO15047 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SETD1AO15047 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SETD1AO15047 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SETD1AO15047 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SETD1AO15047 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
SETD1AO15047 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SETD1AO15047 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
SETD1AO15047 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SETD1AO15047 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SETD1AO15047 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SETD1AO15047 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SETD1AO15047 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SETD1AO15047 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SETD1AO15047 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SETD1AO15047 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.18
SETD1AO15047 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
SETD1AO15047 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SETD1AO15047 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SETD1AO15047 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SETD1AO15047 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SETD1AO15047 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SETD1AO15047 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SETD1AO15047 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SETD1AO15047 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SETD1AO15047 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SETD1AO15047 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SETD1AO15047 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SETD1AO15047 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SETD1AO15047 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SETD1AO15047 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SETD1AO15047 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SETD1AO15047 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
SETD1AO15047 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SETD1AO15047 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SETD1AO15047 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SETD1AO15047 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SETD1AO15047 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SETD1AO15047 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SETD1AO15047 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SETD1AO15047 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SETD1AO15047 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SETD1AO15047 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SETD1AO15047 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SETD1AO15047 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SETD1AO15047 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SETD1AO15047 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SETD1AO15047 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SETD1AO15047 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SETD1AO15047 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SETD1AO15047 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SETD1AO15047 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SETD1AO15047 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SETD1AO15047 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SETD1AO15047 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms