Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
IRF6O14896 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IRF6O14896 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IRF6O14896 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IRF6O14896 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IRF6O14896 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
IRF6O14896 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
IRF6O14896 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IRF6O14896 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IRF6O14896 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IRF6O14896 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IRF6O14896 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IRF6O14896 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
IRF6O14896 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
IRF6O14896 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
IRF6O14896 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IRF6O14896 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IRF6O14896 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IRF6O14896 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IRF6O14896 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IRF6O14896 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IRF6O14896 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IRF6O14896 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IRF6O14896 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IRF6O14896 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IRF6O14896 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IRF6O14896 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IRF6O14896 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IRF6O14896 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IRF6O14896 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
IRF6O14896 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IRF6O14896 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IRF6O14896 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IRF6O14896 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IRF6O14896 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IRF6O14896 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IRF6O14896 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IRF6O14896 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IRF6O14896 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IRF6O14896 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IRF6O14896 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IRF6O14896 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IRF6O14896 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IRF6O14896 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IRF6O14896 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IRF6O14896 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IRF6O14896 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IRF6O14896 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IRF6O14896 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IRF6O14896 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IRF6O14896 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IRF6O14896 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IRF6O14896 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IRF6O14896 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IRF6O14896 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IRF6O14896 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IRF6O14896 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IRF6O14896 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
IRF6O14896 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IRF6O14896 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IRF6O14896 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IRF6O14896 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IRF6O14896 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IRF6O14896 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IRF6O14896 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IRF6O14896 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IRF6O14896 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IRF6O14896 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IRF6O14896 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IRF6O14896 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IRF6O14896 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IRF6O14896 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
IRF6O14896 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IRF6O14896 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IRF6O14896 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IRF6O14896 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IRF6O14896 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
IRF6O14896 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IRF6O14896 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IRF6O14896 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
IRF6O14896 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
IRF6O14896 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
IRF6O14896 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IRF6O14896 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IRF6O14896 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IRF6O14896 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IRF6O14896 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
IRF6O14896 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
IRF6O14896 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
IRF6O14896 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
IRF6O14896 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
IRF6O14896 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
IRF6O14896 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IRF6O14896 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
IRF6O14896 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IRF6O14896 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IRF6O14896 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IRF6O14896 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IRF6O14896 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IRF6O14896 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms