Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BHLHE40O14503 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms