Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF4O00268 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF4O00268 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF4O00268 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF4O00268 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF4O00268 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF4O00268 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF4O00268 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF4O00268 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF4O00268 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF4O00268 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF4O00268 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF4O00268 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF4O00268 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF4O00268 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF4O00268 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF4O00268 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF4O00268 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF4O00268 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF4O00268 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF4O00268 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF4O00268 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF4O00268 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF4O00268 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF4O00268 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF4O00268 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF4O00268 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF4O00268 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF4O00268 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF4O00268 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF4O00268 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF4O00268 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF4O00268 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF4O00268 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF4O00268 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF4O00268 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF4O00268 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF4O00268 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF4O00268 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF4O00268 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TAF4O00268 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF4O00268 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF4O00268 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF4O00268 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF4O00268 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF4O00268 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF4O00268 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF4O00268 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF4O00268 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF4O00268 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF4O00268 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF4O00268 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF4O00268 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF4O00268 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF4O00268 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF4O00268 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF4O00268 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF4O00268 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF4O00268 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF4O00268 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF4O00268 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF4O00268 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF4O00268 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF4O00268 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF4O00268 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF4O00268 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF4O00268 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF4O00268 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF4O00268 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF4O00268 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF4O00268 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF4O00268 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF4O00268 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF4O00268 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF4O00268 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF4O00268 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF4O00268 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF4O00268 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF4O00268 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF4O00268 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF4O00268 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF4O00268 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF4O00268 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF4O00268 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF4O00268 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF4O00268 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF4O00268 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF4O00268 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF4O00268 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF4O00268 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF4O00268 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF4O00268 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF4O00268 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF4O00268 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF4O00268 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF4O00268 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF4O00268 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF4O00268 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF4O00268 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF4O00268 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms