Protein–RNA interactions for Protein: O00233

PSMD9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD9O00233 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMD9O00233 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD9O00233 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMD9O00233 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMD9O00233 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMD9O00233 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD9O00233 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD9O00233 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD9O00233 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD9O00233 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms