Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFRSF10AO00220 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFRSF10AO00220 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFRSF10AO00220 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFRSF10AO00220 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFRSF10AO00220 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFRSF10AO00220 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFRSF10AO00220 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFRSF10AO00220 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFRSF10AO00220 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFRSF10AO00220 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFRSF10AO00220 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFRSF10AO00220 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFRSF10AO00220 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFRSF10AO00220 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFRSF10AO00220 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFRSF10AO00220 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFRSF10AO00220 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFRSF10AO00220 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFRSF10AO00220 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFRSF10AO00220 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFRSF10AO00220 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFRSF10AO00220 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFRSF10AO00220 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFRSF10AO00220 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFRSF10AO00220 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFRSF10AO00220 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFRSF10AO00220 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFRSF10AO00220 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFRSF10AO00220 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFRSF10AO00220 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFRSF10AO00220 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFRSF10AO00220 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNFRSF10AO00220 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNFRSF10AO00220 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFRSF10AO00220 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFRSF10AO00220 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFRSF10AO00220 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFRSF10AO00220 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFRSF10AO00220 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFRSF10AO00220 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFRSF10AO00220 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFRSF10AO00220 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFRSF10AO00220 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFRSF10AO00220 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFRSF10AO00220 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFRSF10AO00220 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFRSF10AO00220 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFRSF10AO00220 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFRSF10AO00220 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFRSF10AO00220 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFRSF10AO00220 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFRSF10AO00220 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFRSF10AO00220 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFRSF10AO00220 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFRSF10AO00220 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFRSF10AO00220 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFRSF10AO00220 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFRSF10AO00220 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFRSF10AO00220 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFRSF10AO00220 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFRSF10AO00220 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFRSF10AO00220 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFRSF10AO00220 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFRSF10AO00220 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFRSF10AO00220 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFRSF10AO00220 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFRSF10AO00220 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFRSF10AO00220 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFRSF10AO00220 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFRSF10AO00220 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFRSF10AO00220 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFRSF10AO00220 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFRSF10AO00220 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFRSF10AO00220 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFRSF10AO00220 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFRSF10AO00220 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFRSF10AO00220 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFRSF10AO00220 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFRSF10AO00220 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFRSF10AO00220 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFRSF10AO00220 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFRSF10AO00220 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFRSF10AO00220 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFRSF10AO00220 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFRSF10AO00220 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFRSF10AO00220 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TNFRSF10AO00220 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFRSF10AO00220 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFRSF10AO00220 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFRSF10AO00220 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFRSF10AO00220 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFRSF10AO00220 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFRSF10AO00220 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFRSF10AO00220 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFRSF10AO00220 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFRSF10AO00220 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFRSF10AO00220 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFRSF10AO00220 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFRSF10AO00220 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms