Protein–RNA interactions for Protein: H7C1Q1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1Q1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.33■■□□□ 1
H7C1Q1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
H7C1Q1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
H7C1Q1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H7C1Q1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H7C1Q1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H7C1Q1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H7C1Q1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H7C1Q1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H7C1Q1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H7C1Q1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.32■■□□□ 1
H7C1Q1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H7C1Q1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H7C1Q1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H7C1Q1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
H7C1Q1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H7C1Q1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H7C1Q1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H7C1Q1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H7C1Q1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H7C1Q1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H7C1Q1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H7C1Q1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.3■■□□□ 1
H7C1Q1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.3■■□□□ 1
H7C1Q1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H7C1Q1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H7C1Q1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H7C1Q1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H7C1Q1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H7C1Q1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
H7C1Q1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H7C1Q1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
H7C1Q1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
H7C1Q1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H7C1Q1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
H7C1Q1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H7C1Q1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
H7C1Q1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
H7C1Q1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H7C1Q1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
H7C1Q1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H7C1Q1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H7C1Q1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
H7C1Q1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.27■■□□□ 1
H7C1Q1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.27■■□□□ 1
H7C1Q1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
H7C1Q1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C1Q1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C1Q1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C1Q1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C1Q1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C1Q1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C1Q1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C1Q1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C1Q1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C1Q1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C1Q1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C1Q1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C1Q1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1Q1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1Q1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1Q1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1Q1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1Q1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1Q1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1Q1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1Q1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1Q1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1Q1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1Q1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1Q1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1Q1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1Q1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1Q1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1Q1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1Q1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1Q1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1Q1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1Q1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1Q1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1Q1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1Q1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1Q1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1Q1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1Q1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1Q1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1Q1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1Q1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1Q1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1Q1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1Q1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C1Q1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C1Q1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C1Q1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C1Q1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H7C1Q1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
H7C1Q1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H7C1Q1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H7C1Q1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H7C1Q1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms