Protein–RNA interactions for Protein: C9J4A7

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9J4A7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9J4A7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9J4A7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9J4A7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9J4A7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9J4A7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9J4A7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9J4A7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9J4A7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C9J4A7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9J4A7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C9J4A7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9J4A7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9J4A7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9J4A7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9J4A7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9J4A7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C9J4A7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C9J4A7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9J4A7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9J4A7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9J4A7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9J4A7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9J4A7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9J4A7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9J4A7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9J4A7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9J4A7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9J4A7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9J4A7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9J4A7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9J4A7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9J4A7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9J4A7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9J4A7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C9J4A7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C9J4A7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9J4A7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9J4A7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9J4A7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C9J4A7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9J4A7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9J4A7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9J4A7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9J4A7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9J4A7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9J4A7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9J4A7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9J4A7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9J4A7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9J4A7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C9J4A7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C9J4A7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9J4A7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C9J4A7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C9J4A7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9J4A7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C9J4A7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9J4A7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9J4A7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9J4A7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9J4A7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C9J4A7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9J4A7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9J4A7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9J4A7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9J4A7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9J4A7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9J4A7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9J4A7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9J4A7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9J4A7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9J4A7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9J4A7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C9J4A7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9J4A7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C9J4A7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C9J4A7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C9J4A7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9J4A7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9J4A7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9J4A7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9J4A7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C9J4A7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C9J4A7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
C9J4A7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9J4A7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9J4A7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9J4A7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9J4A7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9J4A7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9J4A7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C9J4A7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C9J4A7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C9J4A7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9J4A7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9J4A7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9J4A7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
C9J4A7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9J4A7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms