Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C9orf172C9J069 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C9orf172C9J069 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf172C9J069 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf172C9J069 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf172C9J069 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf172C9J069 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf172C9J069 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf172C9J069 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf172C9J069 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf172C9J069 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf172C9J069 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf172C9J069 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf172C9J069 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf172C9J069 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf172C9J069 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf172C9J069 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf172C9J069 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf172C9J069 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf172C9J069 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf172C9J069 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf172C9J069 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf172C9J069 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf172C9J069 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf172C9J069 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf172C9J069 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf172C9J069 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf172C9J069 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf172C9J069 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf172C9J069 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf172C9J069 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf172C9J069 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf172C9J069 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf172C9J069 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf172C9J069 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms