Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF879B4DU55 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF879B4DU55 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms