Protein–RNA interactions for Protein: A6NNC1

Putative POM121-like protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNC1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A6NNC1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A6NNC1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A6NNC1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A6NNC1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A6NNC1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A6NNC1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A6NNC1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A6NNC1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A6NNC1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
A6NNC1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A6NNC1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A6NNC1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.33■■□□□ 1
A6NNC1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A6NNC1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A6NNC1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
A6NNC1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A6NNC1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
A6NNC1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A6NNC1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A6NNC1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.3■■□□□ 1
A6NNC1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A6NNC1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
A6NNC1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A6NNC1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A6NNC1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A6NNC1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A6NNC1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A6NNC1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A6NNC1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
A6NNC1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
A6NNC1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A6NNC1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.28■■□□□ 1
A6NNC1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
A6NNC1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.28■■□□□ 1
A6NNC1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
A6NNC1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.28■■□□□ 1
A6NNC1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A6NNC1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A6NNC1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
A6NNC1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
A6NNC1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
A6NNC1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A6NNC1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A6NNC1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A6NNC1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A6NNC1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A6NNC1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A6NNC1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A6NNC1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A6NNC1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A6NNC1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A6NNC1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A6NNC1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A6NNC1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A6NNC1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A6NNC1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A6NNC1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A6NNC1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
A6NNC1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A6NNC1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A6NNC1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A6NNC1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A6NNC1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A6NNC1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A6NNC1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A6NNC1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
A6NNC1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
A6NNC1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A6NNC1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A6NNC1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A6NNC1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A6NNC1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A6NNC1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A6NNC1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A6NNC1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A6NNC1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A6NNC1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A6NNC1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A6NNC1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A6NNC1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A6NNC1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A6NNC1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A6NNC1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
A6NNC1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A6NNC1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A6NNC1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A6NNC1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A6NNC1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A6NNC1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A6NNC1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A6NNC1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A6NNC1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
A6NNC1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A6NNC1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A6NNC1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A6NNC1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A6NNC1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A6NNC1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A6NNC1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms