Protein–RNA interactions for Protein: A6NLU5

VSTM2B, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2BA6NLU5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VSTM2BA6NLU5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VSTM2BA6NLU5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VSTM2BA6NLU5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VSTM2BA6NLU5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VSTM2BA6NLU5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VSTM2BA6NLU5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VSTM2BA6NLU5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VSTM2BA6NLU5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VSTM2BA6NLU5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VSTM2BA6NLU5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSTM2BA6NLU5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSTM2BA6NLU5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VSTM2BA6NLU5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VSTM2BA6NLU5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VSTM2BA6NLU5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VSTM2BA6NLU5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VSTM2BA6NLU5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VSTM2BA6NLU5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VSTM2BA6NLU5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VSTM2BA6NLU5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VSTM2BA6NLU5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VSTM2BA6NLU5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VSTM2BA6NLU5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VSTM2BA6NLU5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VSTM2BA6NLU5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VSTM2BA6NLU5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VSTM2BA6NLU5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VSTM2BA6NLU5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VSTM2BA6NLU5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VSTM2BA6NLU5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VSTM2BA6NLU5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VSTM2BA6NLU5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms