Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
STRCP1A6NGW2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
STRCP1A6NGW2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
STRCP1A6NGW2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
STRCP1A6NGW2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
STRCP1A6NGW2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
STRCP1A6NGW2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
STRCP1A6NGW2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
STRCP1A6NGW2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
STRCP1A6NGW2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
STRCP1A6NGW2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
STRCP1A6NGW2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
STRCP1A6NGW2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
STRCP1A6NGW2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
STRCP1A6NGW2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
STRCP1A6NGW2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
STRCP1A6NGW2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
STRCP1A6NGW2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
STRCP1A6NGW2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
STRCP1A6NGW2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
STRCP1A6NGW2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
STRCP1A6NGW2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
STRCP1A6NGW2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
STRCP1A6NGW2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
STRCP1A6NGW2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
STRCP1A6NGW2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
STRCP1A6NGW2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC35.1■■■■□ 3.21
STRCP1A6NGW2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
STRCP1A6NGW2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
STRCP1A6NGW2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
STRCP1A6NGW2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
STRCP1A6NGW2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
STRCP1A6NGW2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC35.05■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC35■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC35■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms