Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNDIG1LA6NDD5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNDIG1LA6NDD5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNDIG1LA6NDD5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNDIG1LA6NDD5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNDIG1LA6NDD5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNDIG1LA6NDD5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNDIG1LA6NDD5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNDIG1LA6NDD5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNDIG1LA6NDD5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNDIG1LA6NDD5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNDIG1LA6NDD5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNDIG1LA6NDD5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNDIG1LA6NDD5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNDIG1LA6NDD5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNDIG1LA6NDD5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNDIG1LA6NDD5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNDIG1LA6NDD5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNDIG1LA6NDD5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNDIG1LA6NDD5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNDIG1LA6NDD5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNDIG1LA6NDD5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNDIG1LA6NDD5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNDIG1LA6NDD5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNDIG1LA6NDD5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNDIG1LA6NDD5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNDIG1LA6NDD5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNDIG1LA6NDD5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNDIG1LA6NDD5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNDIG1LA6NDD5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNDIG1LA6NDD5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNDIG1LA6NDD5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNDIG1LA6NDD5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNDIG1LA6NDD5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNDIG1LA6NDD5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNDIG1LA6NDD5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNDIG1LA6NDD5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms